Ανεξάρτητη και διαφανής λειτουργία της Δομής
Η χρηματοδότηση του Προγράμματος Γέφυρα αποτελεί τον σημαντικότερο, παράγοντα που επηρεάζει τη βιωσιμότητα, τη λειτουργία της και το εύρος των υπηρεσιών και των ωφελούμενων. Το ζήτημα των πηγών χρηματοδότησης συνδέεται ευθέως με το επίπεδο οργάνωσης του Προγράμματος Γέφυρα, ειδικά στην περίπτωση μεγάλης εμβέλειας της δράσης του.
Πρωταρχικός στόχος, αποτελεί η πρόσκληση εκδήλωσης ενδιαφέροντος και στη συνέχεια η χρηματοδότηση του Προγράμματος Γέφυρα από φορείς του ευρύτερου ιδιωτικού και δημόσιου τομέα, όπως επιχειρήσεις, στο πλαίσιο της εταιρικής κοινωνικής ευθύνης, αναγνωρισμένα Ιδρύματα, κοινωφελείς επιχειρήσεις κ.α.
Μια ακόμη σημαντική πηγή χρηματοδότησης θα αποτελέσουν οι ίδιοι πόροι που θα προέρχονται από την Περιφέρεια Στερεάς Ελλάδας, ως βασικός συντελεστής του Προγράμματος Γέφυρα. Η χρηματοδότηση από τους δημόσιους πόρους θα γίνει άμεσα και έμμεσα. Η άμεση χρηματοδότηση θα προκύψει από ίδιους πόρους του οργανισμού (εθνικοί πόροι) ενώ η έμμεση χρηματοδότηση θα προέλθει μέσω της συμμετοχής του Προγράμματος Γέφυρα σε έργα συγχρηματοδοτούμενα από την Ευρωπαϊκή Ένωση και την Ευρωπαϊκή Επιτροπή.